[已接]科技核心(查重15%),肺癌基因调控网络构建与发病机制研究,临床
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  • 编号标题
  • NO.5941 [已接]科技核心(查重15%),肺癌基因调控网络构建与发病机制研究,临床
  • 任务进度
  • 正出选题 -> 已出选题 -> 正在写作 -> 已交半稿 -> 已交全稿 -> 正在修改
  • 操作时间
  • 任务提交时间 2020-11-11 11:41:09最近跟进时间 2020-11-24 08:58:34
  • 任务内容
  • 稿件题目:根据课题内容和课题名拟题写论文
    稿件字符:9000字符
    要否英摘:要
    文献条数:15
    交稿时间:1周
    保修时间:6个月
    补充说明:

    摘要

    基因调控网络是一个复杂而连续的动态系统网络,是由不同层次的生命元素(DNA,RNA,蛋白质等)相互作用整合而成的调控基因表达的网络,揭示了生命体内各元素间作用机制和它们共同产生的功能,有助于理解复杂疾病的预防、发生、发展及治疗机制。本课题从转录因子、微小RNA(microRNA)、长非编码RNA(lncRNA)和靶基因的实验数据出发,构建人类的基因失调网络;同时构建两种肺癌(小细胞和非小细胞肺癌)的基因失调网络;提取和分析它们中关键网络模体(motif);分组对比分析两种肺癌的基因调控网络,发现它们的异同特点;基于Web可视化技术开发两种肺癌的基因调控网络;收集整理肺癌的通路(pathway)数据,分别对比分析每种肺癌的失调网络与其典型通路,试图找到通路中的关键子通路,并扩展已知通路信息。旨在揭示肺癌中生命元素间的调控机制及提供肺癌诊断、预防和治疗策略。

    项目的研究内容

    (1)从公开的、权威资源中收集实验证实的miRNA与其靶基因、转录因子和miRNA、转录因子与其靶基因、miRNA与其宿主基因,miRNA和lncRNA,lncRNA与其靶基因调控关系数据,构建实验性数据的、人类的基因调控网络,建立相应的人类基因调控网络数据库。所有数据均有文献记载并且均为通过实验方法获得。

    (2)针对肺癌的基因调控网络进行研究和分析,收集两种肺癌(SCLC和NSCLC)中失调表达转录因子、miRNA、lncRNA和基因,基于上述人类基因调控网络,分别建立两种肺癌的失调表达基因调控网络;从两种肺癌的失调调控网络中提取和分析关键网络模体,开发模体提取和分析模块。

    (3)对比两种肺癌的失调表达基因调控网络,发现和分析两种肺癌调控网络的共性和个性。

    (4)分析个性特征是为了研究每种肺癌的识别和诊断;分析共性特征是为了研究它们之间的关键特征。并设计和开发基因调控网络的对比分析模块。

    (5)从权威资源中下载癌症通路(pathway)数据,从Pubmed文献数据库中检索与两种肺癌有关的通路,分别提取和两种肺癌有关通路的数据,对比分析通路与失调网络异同特点。开发失调网络与典型pathway对比分析模块。

    (6)数据库系统的设计与构建,数据字典设计与实现。

    (7)基于web可视化技术设计和开发可视的两种肺癌的基因失调表达网络。使用Linux (Centos7)操作系统,Apache作为Web服务器,Mysql作为数据库。Web前端在设计上使用Photoshop设计Logo和布局。JQuery,在Web前端实现上使用Html、JavaScript、Css、Ajax技术完成前端页面。Web后端采用PHP语言,进行前端数据渲染。

    研究目标

    (1)基于实验数据构建人类肺癌的基因调控网络,同时构建两种肺癌的失调表达调控网络。

    (2)对比两种肺癌的基因调控网络,发现并分析它们的共性和个性;开发完成网络对比分析模块;实现两种肺癌转录和转录后调控水平鉴别。

    (3)提取和分析两种肺癌的关键网络模体,设计和开发模体提取和分析模块。

    (4)对比分析失调网络与典型pathway的异同特点,设计和开发它们的对比分析模块。

    研究数据来源:所有数据均采用National Center for Biotechnology Information Database(NCBI)中gene数据库中的官方标识进行标准化。TarBase(Ver 7.0)、miRTarBase(Ver 3.5)和miRecords(Ver 4.0)

    肺癌基因调控网络构建与发病机制研究  (课题名称



    跟进情况:正出选题

    跟进时间:2020/11/11 14:16:00



    跟进情况:已出选题

    跟进时间:2020/11/16 11:32:06


    跟进情况:定题

    跟进时间:2020/11/24 8:54:15

    3: 肺癌相关的基因共表达网络的构建探究


    跟进情况:正在写作

    跟进时间:2020/11/24 8:58:34

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